На главную страницу

Описание вторичной структуры белка PHOQ_ECOLI

Здесь приведена вторичная структура цепи A белка PHOQ_ECOLI.

  Номера аминокислотных остатков приведены в соответствии с файлом 1id0.pdb, содержащим структуру белка, полученную по данным рентгено-структурного анализа последовательность аминокислот отличается от данных секвенирования генома)

  Первая аминокислота белка имеет номер 335, а последняя — 480.

  Обозначения:
    1) H1 ... H4 — α-спирали.
    2) S1 ... S7 — β-тяжи.

Указаны аминокислотные остатки, принадлежащие этим элементам вторичной структуры.

Метод определения вторичной структуры — с помощью команд редактора RasMol:
    1) Перевод изображения из проволочной модели в остовную;
    2) Раскраска по вторичной структуре: α-спирали окрашиваются в красный цвет, а β-тяжи — в жёлтый;
    3) Щелчок по концевому атому спирали или тяжа приводит к определению его номера.


© Низамутдинов Игорь, 2004